据报道，面对蔡英文的当面征询，陈建仁并没有推托，原因是执政的民进党在去年11月“九合一”选举大败后，需要重新整队再出发，“正面临高度的期待与考验”。

另据台湾“中时新闻网”报道，蔡英文办公室秘书长将由前交通部门负责人林佳龙接任。

报道称，林佳龙在去年底参选新北市长落败后，蔡英文就曾询问他是否愿意担任蔡办秘书长一职，但林佳龙当时并未接受。26日上午两人面谈讨论过后，林佳龙同意出任。

而行政部门副主管一职，传言将由此前被台大认定硕士论文抄袭并撤销学位的前桃园市长郑文灿接任。不过一度有消息传出，为避免郑文灿的论文抄袭事件对新一届行政团队造成冲击，郑文灿与林佳龙的职务可能会对调。

对此，国民党籍台北市议员游淑慧讽刺说，民进党每次重组行政团队都是“辅导失业者就职计划”，认为最后的团队构成仍是派系分赃和小英意志。

中广董事长赵少康批评蔡英文兜了一大圈，最终敲定陈建仁和郑文灿出任行政部门正副主管，应该是山穷水尽，才会组建这样难看的“不伦”行政团队。他形容，蔡英文装神弄鬼折腾了一大圈，还是陈建仁加郑文灿，其实原来就是这两人，但这两人各有各的问题，只好故弄玄虚耍弄一番，最后还是这两人，从来没有变过。

他批评，陈建仁顶着学术光环，大力鼓吹台湾地区自产的高端疫苗，让高端股价一飞冲天，每股从30新台币，涨到400新台币，市值从30亿新台币涨到800亿新台币，高举“爱台湾，打高端”，私下“五鬼搬运，大搞内线”，高端弊案未清，严重“商业不伦”。而郑文灿则是偷抄论文诈骗台大学位，是“学术不伦”，这些人合起来组成一个“推销兼诈骗”的“不伦”的行政团队。